交割合约基础费率普遍高于永续合约，而把全部持仓成本计算在内的话，短期持仓永续合约总成本更低，长期持仓则有可能交割合约整体花费更少。主流交易平台普通用户账户中，永续合约挂单费率大约在0.02%左右，吃单费率0.04%至0.055%区间，交割合约挂单费率会高出0.005%到0.01%，吃单费率差距会更加明显，多数平台交割合约吃单基础费率达到0.06%上下，而且交割合约无法享受部分平台给到永续合约的专属费率减免权益，普通账户很难拿到更低折扣。除此之外交割合约到期结算时还会额外收取一笔固定结算费用，这笔费用不跟随VIP等级降低，不受交易量优惠影响，无论账户等级高低，结算费率统一收取，相当于在原有交易手续费之上增加了一笔固定开支，这也是交割合约单次交易成本偏高的重要原因。
永续合约虽然基础交易手续费更低，但存在交割合约完全没有的资金费率成本，资金费率每八个小时结算一次，只要持仓跨越结算时间节点，就需要支付或者收取对应的资金费用。当市场多头情绪旺盛，资金费率为正值时，持有多单的交易者需要向空单持有者支付费用，持仓时间越久，结算次数越多，累计产生的资金费用就会不断叠加。如果选择短期超短线交易，持仓不超过八个小时，避开资金费率结算时间，永续合约就只产生开仓和平仓的手续费，整体成本会明显低于交割合约，这也是短线交易者大多优先选择永续合约的核心原因。若是跨多个结算周期持仓，资金费率累计金额有可能超过交割合约高出的那部分交易手续费，两者成本差距就会不断缩小。
账户VIP等级变化也会改变两类合约的手续费差距，高交易量的VIP账户可以大幅压低永续合约费率，部分高阶账户挂单费率甚至可以降至负数，产生交易返佣，而交割合约的费率下调空间十分有限，结算费用依旧保持固定标准，不会随着账户等级提升而减少。普通新手账户交易量较低，无法享受费率优惠，交割合约开平仓加上结算的综合成本，要比永续合约高出一截；高阶VIP用户交易永续合约能够拿到更多折扣，两者成本差距会进一步拉大。高频交易人群依靠大量挂单提供流动性，永续合约的低挂单费率优势会被不断放大，频繁开平仓的操作模式下，交割合约偏高的手续费会快速累积，长期下来总成本差距十分可观。
不同交易周期的策略选择，决定了两类合约实际花费的高低，日内短线、超短线快进快出的交易模式，优先选择永续合约可以有效控制交易成本，无需考虑结算附加费用，仅依靠更低的挂单与吃单费率就能节省大量开支。而持仓周期达到数日甚至更久的波段交易，需要持续承担永续合约多次资金费率支出，若是市场资金费率长期处于高位，累积的资金成本会抵消永续合约手续费的优势，这时交割合约固定的手续费加上一次性结算费用，整体总成本反而会更加划算。对冲套保类的交易，交易者注重到期平仓的确定性，即便交割合约手续费偏高，也会优先选择，不用频繁调整仓位，整体额外成本可控。
